feat(output): separate code and docs into subdirectories

Group copied project files under a dedicated code/ directory
Group generated analysis, manifest, and overview under docs/

README.md

@@ -2,6 +2,8 @@
 
 `uipath-explainator` 会按 UiPath 项目入口 `main.xaml` 递归提取 `Invoke Workflow` 和 `Invoke VBA`，复制到指定工作区，删除 `<ui:CommentOut>` 里的无效代码，再重新扫描并裁掉不再使用的文件，最后逐个调用 Gemini 生成说明文档。
 
+输出会自动拆成独立的 `code/` 与 `docs/` 两个子目录，避免说明文档和项目文件混在一起。
+
 ## 安装
 
 ```bash
@@ -26,7 +28,7 @@ GEMINI_MODEL=gemini-2.5-flash
 ```bash
 ./.venv/bin/python -m uipath_explainator \
   /path/to/uipath-project \
-  --output-dir workspace/project-copy \
+  --output-dir workspace/project-bundle \
   --force
 ```
 
@@ -40,11 +42,12 @@ GEMINI_MODEL=gemini-2.5-flash
 
 ## 输出内容
 
-输出目录会保留原项目的相对目录结构，并额外生成：
+输出目录现在是一个 bundle 目录，里面固定包含：
 
-- `manifest.json`: 扫描、剪枝、告警和分析结果清单
-- `OVERVIEW.md`: 总览说明书，除了文件数量，还会解释“初次扫描 -> 清理 Comment Out -> 二次扫描 -> 剪枝 -> Gemini 分析”的整条流水线逻辑
-- `*.analysis.md`: 每个最终保留文件对应的 Gemini 咨询式说明，固定包含：
+- `code/`: 复制出来并经过清理、剪枝后的项目文件，保留原项目相对目录结构
+- `docs/manifest.json`: 扫描、剪枝、告警和分析结果清单
+- `docs/OVERVIEW.md`: 总览说明书，除了文件数量，还会解释“初次扫描 -> 清理 Comment Out -> 二次扫描 -> 剪枝 -> Gemini 分析”的整条流水线逻辑
+- `docs/*.analysis.md`: 每个最终保留文件对应的 Gemini 咨询式说明，固定包含：
   - 文件定位：这个文件在整个流程中的角色、触发方式、核心作用
   - 流程拆解：按步骤说明它是怎么执行的
   - 关键逻辑：条件判断、调用关系、边界情况